Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms