Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB1P82279 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB1P82279 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRB1P82279 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRB1P82279 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRB1P82279 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRB1P82279 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRB1P82279 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB1P82279 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms