Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms