Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HBBP68871 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HBBP68871 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HBBP68871 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HBBP68871 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms