Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBA52P62987 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBA52P62987 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms