Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VBP1P61758 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VBP1P61758 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VBP1P61758 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms