Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVFRD-1P60508 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms