Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDL3P58872 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL3P58872 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms