Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK1P57059 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK1P57059 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK1P57059 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK1P57059 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK1P57059 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK1P57059 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIK1P57059 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK1P57059 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK1P57059 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK1P57059 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK1P57059 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK1P57059 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK1P57059 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK1P57059 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK1P57059 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIK1P57059 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIK1P57059 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIK1P57059 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIK1P57059 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIK1P57059 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms