Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIPPLY3P57055 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms