Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA3P52797 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA3P52797 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms