Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms