Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK4P51957 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK4P51957 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK4P51957 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK4P51957 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK4P51957 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK4P51957 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK4P51957 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK4P51957 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms