Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SMARCA2P51531 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA2P51531 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms