Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms