Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RANGAP1P46060 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RANGAP1P46060 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms