Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3CBP42338 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms