Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5CP41229 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms