Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAEP38570 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms