Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETFBP38117 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETFBP38117 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETFBP38117 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms