Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms