Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms