Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THBS4P35443 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THBS4P35443 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THBS4P35443 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THBS4P35443 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THBS4P35443 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
THBS4P35443 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THBS4P35443 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THBS4P35443 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THBS4P35443 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THBS4P35443 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THBS4P35443 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THBS4P35443 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms