Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA4P34932 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms