Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCKSP29966 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms