Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2E1P29083 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2E1P29083 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms