Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD34P28906 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD34P28906 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD34P28906 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms