Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PEX2P28328 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms