Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms