Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB4P28070 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms