Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTSSP25774 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTSSP25774 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms