Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A1P23297 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A1P23297 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A1P23297 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms