Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSRP1P21291 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms