Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACANP16112 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACANP16112 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACANP16112 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACANP16112 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACANP16112 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACANP16112 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACANP16112 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACANP16112 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACANP16112 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACANP16112 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms