Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
VAV1P15498 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms