Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms