Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms