Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms