Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms