Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL6A2P12110 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL6A2P12110 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL6A2P12110 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL6A2P12110 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL6A2P12110 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms