Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD1P0DJD0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms