Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM2P07951 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM2P07951 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPM2P07951 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPM2P07951 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPM2P07951 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPM2P07951 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPM2P07951 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPM2P07951 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPM2P07951 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms