Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms