Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSF2P04141 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSF2P04141 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSF2P04141 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSF2P04141 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSF2P04141 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSF2P04141 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSF2P04141 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms