Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGAP02671 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGAP02671 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGAP02671 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGAP02671 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms