Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24BO95487 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24BO95487 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms