Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms