Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SKAP2O75563 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKAP2O75563 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms