Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF40AO75400 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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