Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG13O75143 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG13O75143 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG13O75143 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG13O75143 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms